北京兒童醫院精神科目前已開設如下專業細分門診：注意缺陷多動門診、孤獨多動抽動門診、學習困難門診、心理咨詢門診、青春期心理咨詢門診、精神病專病門診、精神殘疾評估門診、腦功能及行為發育門診、腦認知功能評估門診、心身會診聯絡門診等。
北京兒童醫院精神科以追求學科學術水平不斷提高為主要目標，提升學科的核心競爭力。加強研究生教育，持之以恒打造教學方式蕞先進、專業設置蕞齊全的兒童精神醫學高級醫學人才培養平臺。力爭在兒童精神醫學領域的綜合實力達到國內領 先、國際一 流的地位。
北京兒童醫院技術力量雄厚。擁有重點學科兒科學，國家兒童腫瘤監測中心、國家呼吸系統疾病臨床醫學研究中心、國家中西醫協同旗艦醫院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點專科，5個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫療中心。醫院設有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內地位，是中華醫學會兒科學分會、兒外科分會，中國醫師協會小兒外科醫師分會，中華護理學會兒科專業委員會主任委員單位。
在國內率先開展了兒童正常腦發育和神經障礙性疾病的多模態磁共振研究,首次利用酰胺質子轉移成像和磁化轉移成像技術發現兒童腦白質的游離蛋白含量隨著腦發育進程逐漸減低,提出APT成像技術可以用來監測兒童的髓鞘化形成過程。2012年1月提出腦認知功能癱瘓概念(認知癱, Cognitive palsy, CP)，是繼Kanner之后對腦認知的重大推進。這是一個全新的精神病理學概念。目前正利用彌散張量磁共振成像技術建立0-2歲嬰幼兒腦白質模板,以填充和彌補人類腦計劃中嬰幼兒腦發育的空白?
